Omicron新进展，猜想新冠疫情将如何收尾？
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Omicron新进展，猜想新冠疫情将如何收尾？禁断介护,中原证券中签号,oracle外连接,
作者：医殇宏哥
医殇小编按：
其实我很奇怪的是为什么WHO与很多的专家媒体都说2022年疫情会结束这个结论，有没有专家能给我详细的解释下，出于什么原因或科学理论得出这个结论的？
即使目前有些有希望的抗病毒药物的出现，但是同样的我也看到了新冠病毒的不断变异的可能性在逐渐增大，最近很多人又在讨论omicron可能来源于啮齿类动物的反向传播的事，当然我也很早就提过这个可能性，但是如果真的来源于啮齿类动物的反向传播，那么在啮齿类动物中不停传播不停变异的机会可能性大的多了啊。
至于说omicron毒力低的人也比比皆是，但是要搞清楚，omicron的毒力目前还不确认，但是传播力高于其他各类新冠变种这可是事实，如果传播速度远远比现存变异株要快，那么大量患者中的重症率哪怕偏低点也同样会对医疗系统造成冲击，而一旦医疗系统跨掉，就相当于一夜回到解放前，原始毒株在武汉爆发的那种情况了。
另总是说病毒也不希望杀死宿主，说得好像病毒有大爱精神一样，可惜我相信自然是残酷的，鼠疫耶尔森菌这几个世纪来，杀死了多少人了？为啥它没发挥大爱精神，越传播毒力越低呢？
杠精肯定会说，细菌怎么会像病毒那样变异的快的，嗯，我的意思是说病毒不会有思想，如果抗争过努力过，那么人类将来会如何可能还得看老天怎么决定。毒力随着不断传播变弱变成真正的感冒当然是一种可能，突然直接变种毒力加强，世界为此付出惨重代价，人口大幅减少，造成事实上的隔离，最终病毒失去传播条件而消亡难道不是一种可能了么？
来源于细胞大世界、量化爱好者、hanson临床研究
插图：Ana Kova
目前，全球大多数新增病例都来自Delta及其后代。大部分研究人员曾预测Delta谱系将取代最后的“钉子户”。但Omicron的来临给这些预测打了个问号。“我们中的很多人曾以为下一个不走寻常路的变异株会是Delta的后代，Omicron有点出人意料。”英国牛津大学病毒演化专家Aris Katzourakis说。博茨瓦纳和南非的团队在11月下旬发现了Omicron，但研究团队认为Omicron不太可能来自这两个国家，卫生官员认为Omicron与南非豪登省快速发展的疫情相关。Omicron的刺突蛋白上约有30个突变，许多突变都与其他需关注变异株相同，全球科学家正在努力计算Omicron的危险指数。
Omicron的感染病例在南非的快速增加表明，这种新变异株相对Delta又有了适应性优势，比利时鲁汶大学演化生物学家、生物统计学家Tom Wenseleers说。Omicron拥有一些与Delta超高传染性相关的突变。但如果传染性增加是Omicron快速传开的唯一原因，它的R0就会有三十几。Wenseleers说，“这是不太可能的。”
他和其他研究人员猜测，Omicron的成功可能主要是因为它能够感染那些通过打疫苗或既往感染已经对Delta免疫的人群。
科学家对Omicron的了解仍不全面，再过几周才能完全掌握它的特性。但如果Omicron的传播一定程度上靠免疫逃逸能力，那它就符合对新冠病毒演化的理论预测，芝加哥大学演化生物学家Sarah Cobey说。
随着新冠病毒积累传染性优势的速度开始放慢，它就不得不通过逃逸免疫应答的方式保持适应性，Cobey说。举个例子，如果一个突变或一组突变能让疫苗切断传播的作用减半，就会极大增加人群中潜在宿主的数量。Cobey说，很难想象传染性上的任何进一步优势能产生这种效果。
这种从增加传染性向免疫逃逸转变的演化路径在流感病毒等现有的呼吸道病毒中很常见，伦敦卫生与热带医学院的数学流行病学家Adam Kucharski说，“新冠病毒引起新一轮暴发的最简单的方式是逐渐实现免疫逃逸，与季节性冠状病毒差不多。”
实验室研究和流行株测序已在刺突蛋白上发现了大量突变，这些突变能减弱感染和疫苗诱导的中和抗体的效力。携带这些突变的变异株，如Beta，能让疫苗的有效性下降。但它们还无法让疫苗完全失效，尤其是疫苗防重症的作用。
与其他变异株相比，Omicron携带的这类突变要多得多，特别是在刺突蛋白上负责识别宿主细胞的区域。Bloom开展的初步分析显示，这些突变可能会让刺突蛋白的有些部分无法被疫苗和（其他变异株）既往感染诱导的抗体识别，但仍需开展实验室和流行病学研究才能充分理解这些突变的作用。
病毒演化出逃逸免疫应答（如抗体）的能力，也需要付出一些代价。能躲避抗体的某个刺突蛋白突变也许会影响病毒识别宿主蛋白并与之结合的能力。刺突蛋白的受体结合结构域——中和抗体的主要目标——比较小，这个区域能出现的突变可能是有限的，因为它还要行使与宿主细胞ACE2受体结合的使命，德州大学奥斯汀分校结构生物学家Jason McLellan说。
还有一种可能，就是对不同刺突蛋白的反复暴露——无论是通过感染不同的变异株还是通过补打加强针或是两者结合——或许能筑起让新冠病毒难以逃脱的免疫墙。能逃逸有些人抗体应答的突变不尽然能逃逸整个人群的应答；T细胞介导的免疫也是免疫应答的另一股力量，它似乎不易受到病毒突变的影响。
种种限制可能会逼着新冠病毒放慢免疫逃逸的脚步，但它们停下脚步的可能性不大，Bloom说。有明确证据表明，一些能逃逸抗体的突变没有太大的演化代价，McLellan说，“这个病毒永远可以在刺突蛋白的部分区域产生突变。”
病毒转型
新冠病毒如何在免疫作用下演化，对于它会如何发展成地方性流行病毒也有一定的启示。平稳的感染基线是不存在，Kucharski说，“很多人以为将是一条平直线，地方性流行不是这样的。”确切地说，病毒可能会造成规模不一的流行，就像流感和其他常见的呼吸道感染。
Kucharski说，为了预测可能的流行形式，科学家正在评估一个人群对疾病突然易感的速度有多快，以及其方式主要是通过病毒演化、免疫应答减弱，还是通过对该病毒没有免疫力的新生儿。“我觉得，病毒最有可能的演化路径，是通过微小变化让一部分有过暴露史的人发生再感染。”Rambaut说。
对新冠病毒来说最有利——但也最不可能——的结局是像麻疹一样。麻疹感染史或疫苗能带来终身免疫，麻疹病毒主要在新生儿中传播。Bloom说：“即使是麻疹这种几乎没有免疫逃逸能力的病毒也仍然存在着。”
一个更有可能但也同样有利的结局是像呼吸道合胞病毒（RSV）一样。大部分人会在生命的头两年感染这种病毒。RSV是婴儿住院的主要原因，但大部分儿童期的病例都不严重。免疫力减弱和病毒演化的共同作用，让地球上每年都会流行新的RSV变异株，感染大量成年人，但多亏了童年期的暴露，这些成年人病例都不严重。如果新冠病毒照这个方向发展，再加上能预防重症的疫苗，“那它就会成为一种儿童病毒”。Rambaut说。
流感又是另一种情况——或是两种情况。流感A病毒每年会在全球造成季节性流感暴发，其特点是演化速度快，且新变异株能逃逸既往毒株诱导的免疫力。最后的结果是季节性大流行，主要由成年人传播，并可能会出现重症。流感疫苗能减少重症，降低传播速度，但流感A的演化速度太快，意味着疫苗有时候跟不上新的流行株。
如果新冠病毒慢悠悠地演化它的免疫逃逸能力，它就有可能更像流感B。流感B的变异速度比流感A更慢，意味着它的传播主要是靠儿童感染，儿童的免疫力本身就比成年人差一些。
新冠病毒在免疫作用下的演化速度还将决定疫苗是否需要更新，以及多久更新一次。当前的疫苗很有可能需要在某个时间点更新，Bedford说。9月发布的一篇预印本论文[5]中，他的团队发现了新冠病毒比季节性冠状病毒演化快很多的迹象，甚至超过了流感A的速度，而流感A的主要流行株是H3N2。Bedford预计新冠病毒的变异最后会减慢到一种更稳定的状态。“究竟是像H3N2这样需要每一两年更新疫苗，还是每五年更新疫苗，还是更糟糕一点，我并不确定。”他说。
Rambaut等人认为，虽然其他的呼吸道病毒，包括229E这种季节性冠状病毒，为新冠病毒提供了可能的结局，但新冠病毒也可能想走自己的路。Delta的超高传播率和Omicron的出现、低收入国家不平等的疫苗覆盖率、美国和英国等富裕国家少之又少的防疫措施，都为在新冠病毒提供温床，让它能用新的演化方式给我们“惊喜”。
英国政府一个科学顾问组7月编制的一份文件指出，新冠病毒可能会与其他冠状病毒重组，变得更加危险，或是让当前的疫苗失效。在动物宿主中的持续传播，如貂或白尾鹿，也会增加意外突变的可能性，比如能免疫逃逸或致病性增强的突变。
新冠病毒的未来可能依然掌握在人类手中。在疫苗有效性依然很高的时候让更多的人接种，可以防止它引发新一轮疫情。“新冠病毒有很多继续生存的方式，”Rambaut说，“它还没决定好。”
omicron流行
荷兰周日进入封锁状态。随着Omicron变体的迅速蔓延，在圣诞节和新年假期之前，几个欧洲国家面临实施更多新冠限制的可能性。
而在美国，白宫医疗顾问福奇(Anthony Fauci)呼吁出门探亲访友的人要打加强针，在拥挤的公共场所务必要戴上口罩。
他说Omicron正在“全球肆虐”，即使是已经接种疫苗的人，旅行也会增加感染的风险。根据媒体的统计，自本月开始，美国的COVID病例已经上升了50%。
荷兰开始实施紧急封锁，打乱了人们的圣诞假日安排，各个市区基本上空荡无人。
荷兰总理吕特在周六晚间宣布命令，从周日起到至少1月14日，除了必要的商店以外，其它所有商店以及餐馆、理发店、健身房、博物馆和其他公共场所需全部关闭。
世界卫生组织(WHO)周六表示，Omicron变种已在全球广泛传播，目前有89个国家和地区报告发现该变种病例。WHO称，在发生社区传播的地区，病例数在1.5到3天内翻倍，但关于Omicron仍然有很多未知情况，包括所引发病症的严重程度。
荷兰采取行动，关闭了大部分公共活动，以防止其医疗系统变得不堪重负，其他一些欧洲国家的政府正在考虑采取额外的限制措施，而此时企业正指望人们在购物、娱乐和旅行方面有远远超出平时的支出。
在媒体追踪的240个国家和地区中，64个国家或地区的COVID总体感染率正在上升，12个国家的病例数比疫情期间的任何时候都多，包括英国。
英国卫生大臣贾伟德(Sajid Javid)周日拒绝排除约翰逊政府将在圣诞节前实施进一步限制的可能性。
据当地报纸周日报导，意大利政府正在考虑采取新的措施，以避免在假期期间出现感染率激增。
据晚邮报报道，在12月23日与部长们会面后，意大利总理德拉吉可能会规定已经接种疫苗的人也要出示阴性检测证明才能进入人群密集的地方，包括夜总会和体育场。
德国卫生部长劳特巴赫(Karl Lauterbach)周日排除了圣诞节期间实施封锁的可能性，但他警告说第五波疫情或许已经无法阻止，并补充说他认为强制接种疫苗是结束疫情的唯一途径。
omicron研究新进展
新冠病毒Omicron突变株正在全球掀起新一轮COVID-19疫情。流行病学研究是揭示Omicron突变株传染性、免疫逃逸和病情严重程度的基础，也是做好预防和疫苗接种部署的关键。
2021年12月16日，丹麦学者于Euro Surveill（欧洲检测）发表了785例丹麦Omicron感染者的流行病学特征，并与同期的Delta突变株感染者进行了比较，提供非常重要的信息。我们做一解读。
丹麦于2021年11月28日首次在南非返回的旅行者中发现了两名Omicron感染者，截止到12月9日，共登记了785名感染者。
需要说明的是，文章报道的是Omicron variant cases，而不是patients；我们在这里把cases翻译成感染者。需要首先区别研究对象是患者，还是感染者，才能在后面做出科学客观的理解，尤其是与既往认识做比较时。
丹麦报道的cases是全国检测数据，而不是医院的数据，也就是说，其cases的定义是RT-PCR或者全基因组测序（WGS）确定的Omicron感染者。需要特别提到的是，丹麦针对新冠的检测在全球亦处于领先位置，检测范围不仅仅是临床确诊病例，也包括确诊病例的密切接触者，还包括从12月1日开始对所有国际旅行者的检测。
所以丹麦的这项流行病学研究，展示的是Omicron感染者相对完整的情况；而这正是各国研究者急需知道的数据资料。
丹麦的研究显示，该国Omicron病例从12月4日开始，每天增长40%。这意味着不到两天就翻一番。
1、感染者的人口学特点
感染者年龄从2岁到95岁，年龄中位数为32岁；55%为男性；77%无旅行史，显示这组研究更接近社区感染病例。
2、Omicron感染者的疫苗接种史和既往新冠病毒感染史
这组Omicron感染者中，共有83.1%完全接种或者加强接种了疫苗，其中有76%接种了2剂疫苗，另有7.1%接种了第3剂疫苗。另有4.3%既往感染过新冠病毒。而Delta感染者中，则只有53.2%完全接种或者加强接种了疫苗。只有0.9%既往感染过新冠病毒。
3、Omicron感染者的病情
可以看到，报告了症状的Omicron感染者中，有73%有症状，27%无症状。Omicron感染者中，有1.2%住院，对比Delta感染者为1.5%；Omicron感染者中，有0.13%住ICU，对比Delta感染者为0.11%；Omicron感染者中，没有病例死亡，对比Delta感染者为0.07%。
Hanson解读：
这是针对Omicron突变株的第一项流行病学研究，尽管样本量小，但是丹麦做的检测非常完善，所以仍然提供了非常关键的资料。
(丹麦、英国、美国的疫情)
这组资料也继续验证着：
1、Omicron突变株有高于Delta突变株的免疫逃逸
83.1%的Omicron感染者既往接种过2剂或以上疫苗。不过这组数据，也让我们首次看得，原来Delta突变株的感染者也有50%接种过2剂剂以上疫苗。而丹麦已有77.5%的人群完全接种过疫苗，仍然未能阻挡新冠病毒Omicron突变株的蔓延。
2、Omicron的传染性极强
正如本文及上图展示的，一旦Omicron蔓延开来，不到2天就翻一番。
3、Omicron感染者1.2%住院，0.13%需要入住ICU
所以真实世界中Omicron感染者的症状确实不重。但是比之前毒株更弱吗？Delta感染者也仅有1.5%住院，0.11%需要住ICU。本文没有做统计学比较，我们猜想是由于作者考虑到样本量小，担心结论不可靠。
但这个结果已经显示，本组中Omicron突变株感染者和Delta突变株感染者的病情严重程度差不多；但不要忘了，Omicron组有更高比例的疫苗接种者和既往感染者。实际上，疫苗接种使得真实世界中COVID-19患者的病情普遍变轻。
4、我们有理由放松吗？
看到这个结果，个人肯定是更敢和家人一起外出过圣诞节了。但条件是：完全接种疫苗或者接种加强针；另外就是严格戴好口罩、保持距离。但政府和公卫管理者却更为焦虑和紧张。因为感染病例数增高，意味着全社会的住院和病死总数会增高。
更关键的是，根据另外一项挪威研究的病例报道，疫苗接种后Omicron感染者的常见症状已经完全不同，最常见的症状依次是：咳嗽（83%）、流涕（78%）、疲劳（74%）、咽痛（72%）和头痛（68%）。你看，和流感有区别吗？
（疫苗接种者）早期症状和流感区别不大的Omicron突变株，无疑会降低感染者就诊的意向和防疫的难度。
但是，和流感相近的Omicron感染者，是由于Omicron突变株吗？挪威研究的答复是“否”。目前挪威Omicron感染者的Delta突变株感染者的症状没有区别，都是由于疫苗接种，降低了病情的严重程度。
说了这么多，做一简单小结：
1、Omicron突变株传染性极强，一旦传播开，病例两天翻一番。所以，第一时间诊断和隔离，非常关键。
2、Omicron突变株对疫苗的免疫逃逸非常明显，但是Delta突变株也更加活跃。因为疫苗接种时间延长后，保护力就是降低嘛。所以，加强接种，非常关键。
3、好消息是，真实世界中发现，Omicron感染者的症状确实较之前轻（1.2%住院，0.13%入ICU），但是目前没有证据比Delta突变株感染者更轻（1.5%住院，0.11%入ICU）。目前的感染者症状都变轻了，主要是由于大部分感染者都完全接种了疫苗。
4、坏消息是，Omicron感染者的早期症状和流感真是很像，这也会增加防疫的难度。
所以，大家感染Omicron的几率明显增高；但是完全疫苗接种者的Omicron感染后症状相对来说不是如之前那么可怕，但和Delta感染者很可能仍旧差不多。希望对首篇Omicron感染者流行病学的研究，对您准确理解目前的疫情有些帮助。
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