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信息来源:互联网 发布时间:2023-07-14
记者12月29日从国际竹藤中间召开的竹藤基因组学学术功效公布会上得悉:继2013年公布了首个竹亚科的全基因组——毛竹全基因组数据以后,国际竹藤中间历经5年的不懈勤奋,在竹藤基因组学方面又获得了一系列打破性科研功效
记者12月29日从国际竹藤中间召开的竹藤基因组学学术功效公布会上得悉:继2013年公布了首个竹亚科的全基因组——毛竹全基因组数据以后,国际竹藤中间历经5年的不懈勤奋,在竹藤基因组学方面又获得了一系列打破性科研功效。
第二项打破性科研功效是公布了最新毛竹高精度基因组数据。2013年国际竹藤中间公布毛竹全基因组数据,标记着中国竹子基因组学研讨正式进入全基因组时期。以后,国际竹藤中间负担了对毛竹全基因组数据保护和完美、进步的事情,历经艰辛攻关,已完成并公布了最新毛竹染色体程度的参考基因组两性相处的案牍句子。最新版本的毛竹基因组数据次要利用了自立开辟的手艺和办法两性相处最好的形态案牍两性相处最好的形态案牍,其次要目标片面优于初版本,出格是一些权衡组装质量的主要目标更是高于初版本200多倍。比拟第一个版本的毛竹基因组数据,最新版本的毛竹基因组数据精度更高,对后续尝试更具有指点意义。因而,最新毛竹高精度基因组完美、进步和正文事情的完成,标记着国际竹藤中间不惟一才能公布全基因组数据,更有才能连续保护和完美两性相处的案牍句子、进步全基因组数据。
第一项打破性科研功效是初次胜利破解了2种棕榈藤全基因组数据。棕榈藤是热带和南亚热带丛林宝库中的多用处非草本动物资本,原藤是仅次于木料和竹材的主要林产物,具有主要的生态和经济代价。环球每一年藤产业产值约为70亿美圆。国际竹藤中间主任江泽慧暗示,单叶省藤和黄藤两个染色体程度的全基因组测序事情的完成,弥补了天下棕榈藤基因组学研讨空缺,也标记着我国棕榈藤生物学根底研讨获得了严重打破。
第三项打破性科研功效是片面启动施行环球首个竹藤科研项目——环球竹藤基因组方案。2016年,由国际竹藤中间,深圳华大性命科学研讨院等单元配合倡议,多个国度相干科研单元或大学配合到场的环球竹藤基因组方案 (GABR)正式公布。本方案分为竹子和棕榈藤两个分方案。全部方案旨在搜集环球代表性竹藤样品,从组学角度答复,“竹藤从何而来,怎样演变,怎样开展”等成绩,这也是竹藤生物演变研讨中最根底的科学成绩。大范围基因组数据的使用使得物种的演变过程得以重现两性相处的案牍句子。同时,这是迄今为止对竹藤两物种最大范围的基因组演变过程阐发,也是操纵比力基因组学提醒生物宏观演变汗青的主要一步。全部项目估计将在环球范畴内普遍采样两性相处的案牍句子,从中将挑选测序组装100个竹藤基因组和1000个竹藤转录组。“今朝项目曾经完成中国大陆地域的400多种竹子收罗事情两性相处最好的形态案牍两性相处最好的形态案牍。受益于测序手艺的快速开展和组学数据的普遍利用,我们将构建最高可托度竹子/棕榈藤份子演变树,将史无前例地处理对竹子/棕榈藤演变干系的汗青争辩。”江泽慧如是说。
“这些功效标记着我国竹藤份子生物学研讨获得了严重打破两性相处最好的形态案牍,一直处于天下抢先程度。出格是初次破译棕榈藤全基因组信息,得到了两个高精度的棕榈藤全基因组数据,功效在威望基因组学杂志《大数据》上揭晓,弥补了棕榈藤动物基因组信息的空缺,对下一步深化展开棕榈科动物的功用基因组学、比力基因组学研讨具有严重的科学代价,对引领环球棕榈藤将来的基因科技财产开辟具有深远的汗青意义。”列席公布会的国度林业和草原局副局长彭有冬说。他以为,我国竹藤品种、资本储量、财产开展和科研程度均居国际抢先职位,是天下竹藤财产的次要手艺研发国。本次公布的功效为基于生物信息手艺的竹藤动物性命科学研讨奠基了坚固根底,为发掘调控竹藤动物速生、高强、高韧等主要性状相干功用基因,展开份子育种开拓了新路子。
以上三个项目在2017-2018年间,别离在线揭晓在国际威望学术期刊英国牛津出书社《大数据》杂志上。
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